TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g59030
TIGR annotation:copper transporter 1 (COPT1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1232   347.61
 617 
 643.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1096   23.55
 1057.9 
 1048.5 
 1044.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  826.8   51.45
 911.3 
 824 
 917.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1049.9   76.39
 1159.1 
 1235.5 
 1160.1 
 0.70 Seedling (SL01)  1558.8   121.51
 1483.3 
 1321 
 0.70 Seedling (SL02)  2088.4   96.6
 2072.4 
 1913.7 
 0.70 Seedling (SL10)  881.2   41.8
 798 
 832.5 
 0.70 Seedling (SL12)  1615.7   285.78
 1932.4 
 1362 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  485.6   12.16
 463.3 
 482.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  300.6   44.66
 260.6 
 211.4 
 1.00 Seedling (SL07)  1672   102.3
 1527.3 
 1.00 Seedling (SL09)  2894.5   177.68
 3080.8 
 2725.6 
 1.00 Seedling (SL11)  1228.6   248.22
 1210.7 
 1107.4 
 697.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  425.1   16.92
 449 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  992.4   85.7
 1147.4 
 1006.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  2093.5   89.26
 1922.7 
 1963.2 
 1.02 Seedling (SL08)  1259.1   150.26
 1471.6 
 1.02 Roots (RT01)  434.5   77.59
 544.2 
 1.02 Lateral roots (RH01)  330.7   40.27
 352.7 
 274.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1410.2   102.71
 1283.6 
 1487 
 1.05 Rosette (LF11)  1293   112.93
 1290.6 
 1487.4 
 1.14 Rosette (LF12)  2306   243.34
 2635.6 
 2160.7 
 1.14 Rosette (LF13)  2108.2   357
 2613.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  2508.1   73.97
 2463.4 
 2363.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1649   48.98
 1554.4 
 1579.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1466.4   72.93
 1346.1 
 1477.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1844   129.65
 1712.8 
 1584.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  2127.9   553.1
 3233.1 
 2640.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1583.5   939.18
 3271.8 
 3140.7 
 3.90 Rosette (SH01)  2373.4   182.75
 2025.2 
 2102.9 
 3.90 Roots (RT04)  319.6   20.87
 359.6 
 350.1 
 3.90 Roots (RT05)  451.2   50.88
 552.4 
 510.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1034.1   229.28
 1425.3 
 1246.9 
 906.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1400.4   293.6
 985.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  2139.8   844.72
 1405.3 
 3090.1 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1583.6   624.91
 2205.6 
 2833.4 
 5.10 Roots (RT02)  259.1   52.86
 333.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  277.3   23.16
 310 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  338.2   11.67
 354.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2057.3   42.02
 2116.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  4146.4   796.32
 5272.6 
 6.00 Leaf (LF08)  2122.9   323.05
 2616.6 
 2730.7 
 6.00 Leaf (LF16)  3045.7   317.38
 3502.6 
 3655.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  780.7   341.12
 1263.1 
 6.10 Leaf (LF10)  3016.6   632.24
 2174.4 
 1778.7 
 6.10 Stem base (ST01)  890.6   37.37
 943.5 
 6.10 Stem top (ST02)  1107.6   166.22
 872.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  1388.3   117.44
 1222.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  551.1   70.15
 650.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1107.5   247.35
 1593.6 
 1271.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  721.7   99.81
 779.2 
 916 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1147.2   221.89
 1385.9 
 1590.5 
 Suspension cell culture (SU01)  242   25.13
 241.1 
 285.1 
 Suspension cell culture (SU02)  1099.3   105.22
 1248.1 
 Xylem (XL01)  223.5   3.23
 227.1 
 229.9 
 Cork (CR01)  357.4   42.72
 290.2 
 278.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  627.6   533.23
 1600.6 
 735.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  862.5   99.3
 810.1 
 670.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  860.9   68.85
 730.1 
 758 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1088.5   350.97
 413.6 
 583.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1386   165.1
 1079.2 
 1126.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1791.8   890.74
 675.2 
 2435.7 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  714.7   441.47
 1530.4 
 830 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1085.5   241.94
 619.4 
 739.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  930.7   68.87
 1060.5 
 955.6 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress