TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g59040
TIGR annotation:copper transporter family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  164.4   31.33
 222.7 
 173.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  177.9   3.78
 170.6 
 172.6 
 178.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  187.3   2.89
 192.2 
 191.3 
 194.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  180.4   7.59
 196 
 186 
 179.4 
 0.70 Seedling (SL01)  157   4.69
 161.4 
 166.4 
 0.70 Seedling (SL02)  295.8   12.91
 275.9 
 271.5 
 0.70 Seedling (SL10)  201.5   1.8
 201.8 
 198.5 
 0.70 Seedling (SL12)  260.8   27.61
 315.9 
 286.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  155.2   8.1
 139.9 
 142.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  234.4   35.49
 173 
 234.6 
 1.00 Seedling (SL07)  211.8   31.72
 167 
 1.00 Seedling (SL09)  177.2   5.57
 185.8 
 175.3 
 1.00 Seedling (SL11)  183.5   30.22
 215.4 
 145.4 
 162 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  206.4   8.66
 194.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  208.7   33.86
 276.5 
 242.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  298.3   27.96
 246.9 
 253.6 
 1.02 Seedling (SL08)  218.7   14.62
 198 
 1.02 Roots (RT01)  159.4   23.4
 192.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  196.4   14.19
 181.4 
 209.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  236   2.82
 240.4 
 235.1 
 1.05 Rosette (LF11)  168.3   32.95
 223 
 227.5 
 1.14 Rosette (LF12)  254.7   15.61
 252.1 
 280.3 
 1.14 Rosette (LF13)  304.7   2.05
 307.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  203.8   4.69
 207.6 
 198.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  274.6   21.55
 313.3 
 310.3 
 3.70 Adult leaf (LF02)  302.3   4.21
 295.3 
 302.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  299   30.04
 240.1 
 259.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  231.7   72.26
 240.3 
 360.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  170.7   60.74
 271.9 
 279.5 
 3.90 Rosette (SH01)  265.3   23.97
 247.7 
 217.8 
 3.90 Roots (RT04)  196   31.99
 209.1 
 256.8 
 3.90 Roots (RT05)  202.2   9.19
 184.3 
 196.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  203.4   18.1
 210.2 
 213.4 
 173.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  375.2   46.69
 441.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  263   517.47
 1220.9 
 402.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  218.2   37.02
 287.6 
 275.3 
 5.10 Roots (RT02)  127.2   47.97
 195 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  6170.7   501.27
 5461.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  5525.7   1427.34
 3507.2 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  428.3   8.67
 416.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  1185.1   640.56
 279.2 
 6.00 Leaf (LF08)  241.7   17.35
 273 
 244.3 
 6.00 Leaf (LF16)  170.1   28.61
 226.2 
 188.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  168.5   49.23
 238.1 
 6.10 Leaf (LF10)  252.4   24.16
 294.7 
 293.9 
 6.10 Stem base (ST01)  164.9   9.83
 178.8 
 6.10 Stem top (ST02)  381.2   35.34
 331.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  167.8   18.81
 141.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  137.9   4.14
 132 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  275.3   28.47
 218.5 
 243.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  188.5   9.25
 206.5 
 201.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  349.2   53.81
 250.2 
 263.1 
 Suspension cell culture (SU01)  121.5   20.54
 160.7 
 151.8 
 Suspension cell culture (SU02)  153.6   6.7
 144.1 
 Xylem (XL01)  259.5   16.81
 260.9 
 231.1 
 Cork (CR01)  260.5   32.94
 287.5 
 326 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  497.7   67.15
 632 
 564.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  533.7   91.48
 499.7 
 672.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  507.6   16.36
 505 
 534.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  444.8   143.05
 691 
 441.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  397.5   64.7
 490.2 
 522 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  510.9   125.29
 269.2 
 447.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  609.5   100.05
 522.4 
 722 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  223.1   341.28
 279.7 
 840.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  520   283.66
 696.1 
 141 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress