TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g59080
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  64.4   7.17
 70.9 
 56.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  51.5   37.09
 80.3 
 131.5 
 54.2 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  86   31.59
 55.9 
 119 
 123.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  71.8   7.66
 69.4 
 65 
 83 
 0.70 Seedling (SL01)  252.6   24.89
 274 
 224.4 
 0.70 Seedling (SL02)  373.9   45.7
 387.1 
 458.8 
 0.70 Seedling (SL10)  82.5   8.47
 96.9 
 97.4 
 0.70 Seedling (SL12)  128.1   9.89
 146.8 
 143 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  608.7   177
 900.3 
 928.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  284   5.47
 273.2 
 279.8 
 1.00 Seedling (SL07)  467.8   18.65
 441.4 
 1.00 Seedling (SL09)  510.9   72.06
 486.2 
 375.6 
 1.00 Seedling (SL11)  582.1   133.19
 473.6 
 320 
 301.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  91.5   0.92
 92.8 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  212.5   60.95
 117.6 
 98.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  345.5   18.89
 308 
 323.2 
 1.02 Seedling (SL08)  75.1   0.34
 75.6 
 1.02 Roots (RT01)  187.9   4.33
 194 
 1.02 Lateral roots (RH01)  63.4   8.54
 77.7 
 78.6 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  162.6   25.23
 153.8 
 201.2 
 1.05 Rosette (LF11)  296.3   63.96
 184.3 
 186.8 
 1.14 Rosette (LF12)  462.6   77.85
 335.6 
 477.1 
 1.14 Rosette (LF13)  262.4   32.08
 307.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  1195.4   87.89
 1053.1 
 1034.8 
 3.70 Adult leaf (LF01)  386.7   6.05
 377 
 388.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  205   7.82
 214.1 
 198.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  169.4   7.63
 160.3 
 154.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1725.5   491.43
 893.8 
 856.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  599.5   1118.64
 2655.8 
 2390.9 
 3.90 Rosette (SH01)  391.1   88.85
 233.3 
 241.4 
 3.90 Roots (RT04)  68.8   3.61
 75.6 
 70.1 
 3.90 Roots (RT05)  143   18.54
 122.9 
 106 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  114.9   22.9
 69.7 
 78.4 
 63.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  110.5   31.81
 155.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  129.9   4.65
 120.6 
 124.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  236   38.86
 173.4 
 164.9 
 5.10 Roots (RT02)  99.4   23.69
 65.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  62.9   12.07
 79.9 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  58.1   1.14
 56.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  77.6   25.7
 113.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  71.3   6.19
 80 
 6.00 Leaf (LF08)  990.5   322.53
 1571.4 
 1523.9 
 6.00 Leaf (LF16)  1016.6   61.92
 1140 
 1086.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  48.3   25.91
 85 
 6.10 Leaf (LF10)  396.9   130.82
 189.1 
 155.3 
 6.10 Stem base (ST01)  219.9   7.44
 209.4 
 6.10 Stem top (ST02)  70.1   2.35
 73.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  135   15.94
 157.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  53.7   10.54
 68.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  75.7   67.42
 203.6 
 176.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  67.1   49.93
 161 
 84.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  98.4   20
 64.2 
 99.3 
 Suspension cell culture (SU01)  46.4   1.9
 47.4 
 50.1 
 Suspension cell culture (SU02)  47.2   6.87
 56.9 
 Xylem (XL01)  163.7   31.03
 134.9 
 101.7 
 Cork (CR01)  514.8   17.61
 515.9 
 545.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  257.4   36.93
 278.6 
 329.3 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  260.7   22.75
 288.9 
 305.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  212.1   18.71
 249.4 
 228.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  166.6   52.47
 185.6 
 265.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  241.7   30.46
 300.5 
 284.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  251.9   63.27
 141.2 
 249.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  466.3   84.19
 305.9 
 341.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  111.5   199.93
 76.8 
 439.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  361.7   404.55
 1094.1 
 430.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress