TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g61750
TIGR annotation:cupin family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  146   25.79
 196.8 
 164 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  139.2   20.41
 125.2 
 168.4 
 163.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  147.6   9.16
 141.7 
 128.9 
 149 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  144.9   7.55
 149 
 162.1 
 155.4 
 0.70 Seedling (SL01)  156.4   11.51
 166.7 
 179.4 
 0.70 Seedling (SL02)  166.5   14.88
 156.9 
 137.3 
 0.70 Seedling (SL10)  90.2   15.05
 105.5 
 75.5 
 0.70 Seedling (SL12)  100.1   13.85
 125.6 
 103.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  103   9.13
 115.5 
 120.8 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  123.7   8.6
 112.4 
 129.3 
 1.00 Seedling (SL07)  132.3   8.29
 120.6 
 1.00 Seedling (SL09)  69.6   9.36
 80.2 
 61.5 
 1.00 Seedling (SL11)  110.3   24.45
 93.9 
 59.7 
 63.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  158   4.34
 151.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  179.2   29.59
 203.8 
 144.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  156.8   22.51
 127.4 
 171.6 
 1.02 Seedling (SL08)  119.1   13.73
 138.5 
 1.02 Roots (RT01)  144.7   16.07
 121.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  152.7   7.38
 158.6 
 143.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  133.8   15.83
 119.6 
 102.2 
 1.05 Rosette (LF11)  140.2   1.65
 137.3 
 137.4 
 1.14 Rosette (LF12)  122.2   8.56
 120.1 
 135.9 
 1.14 Rosette (LF13)  123.7   14.35
 144 
 3.20 Whole plant (WP05)  133.6   2.27
 132.7 
 129.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  158   48.33
 252.6 
 188.2 
 3.70 Adult leaf (LF02)  171.3   5.53
 160.3 
 166.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  160   21.79
 200 
 195 
 3.90 Adult leaf (LF03)  181.9   22.58
 136.9 
 161.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  208.6   32.37
 151.6 
 153.5 
 3.90 Rosette (SH01)  112.8   16.56
 116.4 
 143.1 
 3.90 Roots (RT04)  141.3   8.74
 127.5 
 143.7 
 3.90 Roots (RT05)  165.4   9.35
 147.3 
 160.4 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  145   5.99
 135.3 
 136.9 
 130.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  95   10.86
 79.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  149   14.28
 123.7 
 124.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  169.2   23
 140.4 
 123.8 
 5.10 Roots (RT02)  143.8   8.99
 131.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  200.5   37.82
 254 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  180.3   62.84
 269.2 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  265.6   22.97
 298.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  259.3   37.11
 311.7 
 6.00 Leaf (LF08)  160.9   0.59
 159.8 
 159.9 
 6.00 Leaf (LF16)  94.2   13.5
 85.2 
 67.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  228.1   43.22
 167 
 6.10 Leaf (LF10)  150.5   20.55
 111.7 
 142.8 
 6.10 Stem base (ST01)  176.7   29.65
 218.6 
 6.10 Stem top (ST02)  140   23.45
 173.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  111.6   1.06
 110.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  92.4   9.53
 105.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  148.1   6.33
 137.3 
 137 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  129.1   26.49
 178.7 
 170.1 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  174.8   24.04
 155.3 
 127 
 Suspension cell culture (SU01)  148.1   14.24
 120.1 
 138.8 
 Suspension cell culture (SU02)  172.3   2.65
 168.6 
 Xylem (XL01)  127.7   1.89
 126.5 
 124 
 Cork (CR01)  112.3   9.67
 114.4 
 96.7 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  519.1   65.59
 584.7 
 453.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  785.8   324.27
 488.1 
 1136 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  392.4   197.52
 781.5 
 528 
 Heart embryo, roots (EHR1)  362.4   80.4
 417.5 
 520.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  274   50.34
 370.2 
 347.7 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  318.2   58.34
 226.2 
 334.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  691.9   110.24
 535.8 
 478.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  255.2   196.89
 198 
 564 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  423.9   186.88
 797.4 
 620.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress