TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g61820
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1668.2   497.08
 2149.7 
 1155.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  2975.7   126.97
 2825 
 3124.2 
 2905.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  2429.3   119.21
 2498.8 
 2691.4 
 2627.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1237.1   74.48
 1121.7 
 1082 
 1216.7 
 0.70 Seedling (SL01)  1018.9   169.31
 1332.2 
 1064.2 
 0.70 Seedling (SL02)  1837.7   58.41
 1922.4 
 1810.4 
 0.70 Seedling (SL10)  836.6   34.79
 769.7 
 819.6 
 0.70 Seedling (SL12)  681.5   94.08
 760.7 
 573.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  3464   362.67
 4125.5 
 4052.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  2032.2   117.14
 2191 
 1962.4 
 1.00 Seedling (SL07)  4371.4   103.21
 4225.5 
 1.00 Seedling (SL09)  3333.2   281.04
 3127.8 
 2777.4 
 1.00 Seedling (SL11)  2351.7   107.38
 2335.6 
 2457.5 
 2196 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1063.8   150.06
 851.6 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1474.4   231.44
 1121.4 
 1038.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  3189.9   111.84
 3077.9 
 2966.2 
 1.02 Seedling (SL08)  3088.8   156.51
 2867.4 
 1.02 Roots (RT01)  6022   113.85
 5861 
 1.02 Lateral roots (RH01)  392   243.11
 361.4 
 796.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1627.6   299.92
 2206.2 
 1779.9 
 1.05 Rosette (LF11)  998.9   189.13
 1351.3 
 1294 
 1.14 Rosette (LF12)  845.5   657.69
 2064 
 1025.7 
 1.14 Rosette (LF13)  1296.9   450.81
 1934.5 
 3.20 Whole plant (WP05)  1061.3   25.36
 1012.3 
 1025.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2621.1   22.87
 2612.4 
 2655.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  2741.2   44.92
 2812 
 2824.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  454.6   58.8
 505.5 
 388.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1263.4   1196.85
 2720.3 
 3636.7 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1288.4   607.23
 2400.3 
 2267.4 
 3.90 Rosette (SH01)  2043.7   341.35
 2142 
 2677.9 
 3.90 Roots (RT04)  1156.4   164.12
 1204.2 
 1461.5 
 3.90 Roots (RT05)  790.9   17
 783 
 758.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  337.3   113.16
 606.5 
 517.7 
 519.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1602.7   403.94
 1031.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1725.3   688.68
 1444.1 
 2752.4 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  2412.4   842.98
 1984.9 
 3611.1 
 5.10 Roots (RT02)  2071.6   185.67
 1809 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  457.3   1.26
 459.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  626.9   17.82
 601.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  1804   24.85
 1839.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  3144.1   258.22
 2778.9 
 6.00 Leaf (LF08)  2751.6   780.85
 2011.9 
 1190.6 
 6.00 Leaf (LF16)  1777.8   210.67
 2078.5 
 2183.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1186.1   119.77
 1016.8 
 6.10 Leaf (LF10)  2591.1   284.44
 2037.9 
 2199.4 
 6.10 Stem base (ST01)  1362.8   16.51
 1339.4 
 6.10 Stem top (ST02)  556.8   31.47
 512.3 
 6.10 Flower, open (FL01)  2464.9   138.85
 2268.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  1102   120.89
 1272.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  6374.5   1303.42
 4931 
 3772.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  2338.1   214.4
 2028.7 
 1926.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  5091.5   1286.44
 6200.9 
 7656.6 
 Suspension cell culture (SU01)  2911.9   343.66
 3340.7 
 3591.5 
 Suspension cell culture (SU02)  1575.9   49.91
 1505.3 
 Xylem (XL01)  1842.8   109.94
 2035.9 
 1848.3 
 Cork (CR01)  3137.4   251.2
 2868.3 
 2635.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1363.1   609.9
 376.9 
 248.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  367.3   584.82
 1460.2 
 552.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  292.5   53.84
 387.1 
 295.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  233.8   38.13
 269.6 
 310 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  247.8   43.18
 255.9 
 326.3 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  300.1   131.74
 495.9 
 245.3 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  443.6   126.76
 204.4 
 251.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  403.6   268.88
 927.4 
 770.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  423.7   89.68
 325.4 
 244.6 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress