TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g62520
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  882.6   19.44
 847.9 
 880.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  386.8   60.81
 334.6 
 372.7 
 478.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  389.6   26.81
 344.2 
 400.6 
 400.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  625   134.85
 389.4 
 488.8 
 689.3 
 0.70 Seedling (SL01)  432.7   16.68
 432.2 
 461.3 
 0.70 Seedling (SL02)  398.3   27.38
 452.7 
 430.4 
 0.70 Seedling (SL10)  665.7   32.65
 721 
 723.5 
 0.70 Seedling (SL12)  547.8   36.55
 478.9 
 534.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  337.1   44.11
 257.2 
 329.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  315.9   66.33
 211.4 
 334.5 
 1.00 Seedling (SL07)  516.2   1.83
 518.8 
 1.00 Seedling (SL09)  234.9   22.03
 249.7 
 206.4 
 1.00 Seedling (SL11)  225.5   65.49
 323.9 
 176 
 287 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  382.5   157.15
 604.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  486.5   44.41
 539.4 
 574.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  486.4   28.49
 449.3 
 430.4 
 1.02 Seedling (SL08)  880.9   125.23
 703.8 
 1.02 Roots (RT01)  655.3   20.78
 625.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  482   7.63
 482 
 495.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  586.8   115.63
 700.4 
 469.2 
 1.05 Rosette (LF11)  406.5   93.18
 562.5 
 572.9 
 1.14 Rosette (LF12)  674.3   52.7
 582.7 
 673.6 
 1.14 Rosette (LF13)  474.3   22.79
 442.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  350.2   14.31
 349.8 
 374.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  532.5   31.14
 514.6 
 471.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  554.5   21.69
 545.2 
 586.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  510   106.61
 310.9 
 344.5 
 3.90 Adult leaf (LF03)  465.7   33.5
 514.5 
 529.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  506   196.65
 685.9 
 898.9 
 3.90 Rosette (SH01)  547.8   86.78
 649.7 
 720.4 
 3.90 Roots (RT04)  509.1   17.94
 542.8 
 536.6 
 3.90 Roots (RT05)  373.2   92.08
 547.5 
 511.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  517   36.74
 443.1 
 523 
 483.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  208.1   27.83
 247.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  396.3   55.79
 288.9 
 316.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  388.3   47.07
 315.5 
 403.6 
 5.10 Roots (RT02)  420   100.54
 562.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  410.9   55.69
 332.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  305   32.67
 351.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  392.9   28.72
 352.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  338.4   31.11
 382.4 
 6.00 Leaf (LF08)  581.3   57.81
 664.8 
 553.7 
 6.00 Leaf (LF16)  217.5   36.96
 290.9 
 261.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  343.3   65.42
 435.8 
 6.10 Leaf (LF10)  643.3   10.42
 657.5 
 663.6 
 6.10 Stem base (ST01)  315.4   19.33
 288.1 
 6.10 Stem top (ST02)  421.5   5.53
 413.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  241.1   40.45
 183.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  242   30.38
 199 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  423.1   70.87
 502.3 
 564.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  925.6   575.88
 844.4 
 1880 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  455.6   45.22
 544.7 
 486.6 
 Suspension cell culture (SU01)  647.5   128.42
 886.6 
 848.5 
 Suspension cell culture (SU02)  1010   175.78
 761.5 
 Xylem (XL01)  312   24.71
 352 
 357.2 
 Cork (CR01)  438.4   35.99
 460.9 
 390.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  728.8   112.62
 878 
 949.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  976.3   99.7
 798.9 
 966.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  741.9   95.63
 851.9 
 661.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  711.2   30.67
 765.1 
 712.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  497.8   125.21
 648 
 746.4 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  613.8   178.29
 272.6 
 533 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  872.3   59.02
 894.3 
 782.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  187.5   395.62
 293.4 
 919.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  935.3   569.66
 1403.1 
 269.5 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress