TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g64510
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  161.2   14.06
 167.8 
 140.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  301.9   28.16
 358.9 
 301.9 
 304 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  289.4   12.14
 312.1 
 295.3 
 313.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  349.5   86.09
 159.1 
 177.1 
 242.2 
 0.70 Seedling (SL01)  185.8   16.62
 190.7 
 216.7 
 0.70 Seedling (SL02)  232.1   32.57
 262.3 
 197.2 
 0.70 Seedling (SL10)  111.5   17.44
 85.7 
 78.3 
 0.70 Seedling (SL12)  89.5   9.27
 79.4 
 97.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  193.4   16.23
 187.3 
 162.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  125.2   8.92
 137 
 119.5 
 1.00 Seedling (SL07)  204.7   4.47
 211 
 1.00 Seedling (SL09)  100.5   4.83
 94.6 
 91 
 1.00 Seedling (SL11)  158.5   51.06
 121.5 
 54.1 
 57 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  94.7   3.4
 89.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  183.6   24.25
 223.1 
 178.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  352   18.15
 324.7 
 359.1 
 1.02 Seedling (SL08)  169   17.75
 194.1 
 1.02 Roots (RT01)  226.8   49.41
 296.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  150.5   25.99
 164.1 
 113.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  188   27.67
 150.5 
 134 
 1.05 Rosette (LF11)  201.7   59.58
 319.8 
 274 
 1.14 Rosette (LF12)  188.4   47.8
 283.3 
 225.9 
 1.14 Rosette (LF13)  158.1   2.66
 154.4 
 3.20 Whole plant (WP05)  200.7   14.74
 209.7 
 180.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  272.4   11.33
 285.6 
 263.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  334.8   30.44
 274.9 
 314.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  249.7   42.29
 334.3 
 289.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  339.9   34.29
 271.8 
 312.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  260.3   18.63
 297.5 
 276 
 3.90 Rosette (SH01)  193.8   35.01
 175.6 
 243.2 
 3.90 Roots (RT04)  194.8   27.87
 140.1 
 158.3 
 3.90 Roots (RT05)  225.1   5.29
 224.4 
 233.9 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  240.5   18.54
 239.6 
 213.7 
 203.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  695.3   279.67
 299.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  363.8   297.68
 796.7 
 226.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  263.5   213.36
 286.6 
 644.1 
 5.10 Roots (RT02)  148.8   43.12
 87.8 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  249.7   21.7
 280.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  368.6   7.92
 379.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2919.5   187.8
 3185.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  7252.9   743.66
 8304.6 
 6.00 Leaf (LF08)  429.1   27.31
 376.9 
 389 
 6.00 Leaf (LF16)  262.3   9.24
 272.4 
 253.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  447.9   63.04
 358.7 
 6.10 Leaf (LF10)  221.2   39.19
 165.9 
 145.5 
 6.10 Stem base (ST01)  325.2   10.1
 310.9 
 6.10 Stem top (ST02)  180.6   26.39
 217.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  1103.7   122.58
 930.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  314.3   186.07
 577.4 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  120.3   18.16
 137.4 
 156.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  683.2   197.34
 608.6 
 310.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  266.6   56.3
 357.9 
 369.3 
 Suspension cell culture (SU01)  832   31.97
 769.2 
 790.5 
 Suspension cell culture (SU02)  609.4   12.21
 592.1 
 Xylem (XL01)  126.5   8.17
 139.4 
 141.6 
 Cork (CR01)  145.1   20.09
 109.6 
 111 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  264.1   45.57
 197.5 
 284.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  338.1   57.95
 234.9 
 240.8 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  146.1   68.6
 182.6 
 278.9 
 Heart embryo, roots (EHR1)  195.3   9.78
 207.1 
 187.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  107.7   62.34
 230.5 
 187.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  125   113.7
 352.2 
 246.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  245.8   72.44
 227.8 
 361.3 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  490.1   120.33
 254.1 
 331.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  279.3   170.92
 213.2 
 536.7 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress