TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g67330
TIGR annotation:NRAMP metal ion transporter 4 (NRAMP4)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1886.6   307.28
 2273.4 
 1666.4 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  925.4   43.77
 892.5 
 995.8 
 922.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1016.8   30.78
 1025.8 
 964.6 
 1032.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1065.6   33.44
 1101.7 
 1126.8 
 1142.2 
 0.70 Seedling (SL01)  581.1   43.27
 576.7 
 653.7 
 0.70 Seedling (SL02)  743.6   16.26
 730.6 
 762.9 
 0.70 Seedling (SL10)  1158.4   59.82
 1274.4 
 1190.9 
 0.70 Seedling (SL12)  595.7   54.05
 682.9 
 584.1 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  831.1   73.87
 964.6 
 952.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1016.3   47.76
 1017.6 
 934.2 
 1.00 Seedling (SL07)  968.6   52.98
 893.7 
 1.00 Seedling (SL09)  764.6   58.77
 658.7 
 667.4 
 1.00 Seedling (SL11)  959   182.19
 809.2 
 916.4 
 1236.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  805.9   22.78
 773.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1270.6   215.92
 921.3 
 876.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  704.5   34.8
 698 
 641.3 
 1.02 Seedling (SL08)  923.3   59.52
 839.2 
 1.02 Roots (RT01)  883.7   32.56
 929.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  570   97.4
 601.1 
 752.1 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  855.8   25.22
 806.3 
 822.9 
 1.05 Rosette (LF11)  1008.5   32.45
 1007.2 
 1064 
 1.14 Rosette (LF12)  671   318.87
 1293.4 
 861.9 
 1.14 Rosette (LF13)  929.3   31.14
 885.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  879.1   12.42
 903.9 
 892 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2136.5   102.3
 1936.6 
 1998.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1609.4   44.67
 1548.4 
 1635.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  762.8   61.29
 799.6 
 679.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  622.3   161.89
 866.9 
 928.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  700   241.39
 1182.7 
 932.2 
 3.90 Rosette (SH01)  1474.5   247.57
 995.5 
 1126.3 
 3.90 Roots (RT04)  803.5   30.12
 751.1 
 751.6 
 3.90 Roots (RT05)  710.6   22.61
 706 
 669.3 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  746.3   34.47
 822.3 
 814.3 
 804.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  693.2   19.25
 720.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  762.9   73.11
 773.6 
 894.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  946.2   62.37
 826.4 
 856.2 
 5.10 Roots (RT02)  631.1   60.28
 545.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1414.7   118.72
 1246.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1218.3   51.46
 1145.6 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  282.3   10.44
 267.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  377.1   48.18
 308.9 
 6.00 Leaf (LF08)  1824.2   390.91
 1518.1 
 1048.1 
 6.00 Leaf (LF16)  716.1   47.67
 783.5 
 808.1 
 6.00 Inflorescence (IN01)  556.1   34.45
 604.8 
 6.10 Leaf (LF10)  982.1   63.18
 947.8 
 1070.2 
 6.10 Stem base (ST01)  690.5   3.44
 695.4 
 6.10 Stem top (ST02)  591.9   26.42
 629.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  737.2   29.13
 778.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  497.2   20.34
 526 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  644.5   243.5
 1118 
 782.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1350.1   171.92
 1576.9 
 1239.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1203.8   439.87
 1910.4 
 2010.9 
 Suspension cell culture (SU01)  539.4   115.21
 746 
 731 
 Suspension cell culture (SU02)  617.2   58.56
 534.4 
 Xylem (XL01)  934.6   44.5
 876.4 
 847.2 
 Cork (CR01)  992   59.56
 959.9 
 1075.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  618.8   710.41
 1814.5 
 552 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  688.9   225.35
 556 
 995.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1879   806.35
 466.1 
 499.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1006.3   276.82
 534.8 
 519.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  558.5   348.81
 1241.1 
 1024.3 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  717   131.28
 800.2 
 974.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  2949.3   1077.67
 2398.9 
 869.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  274.1   169.63
 359.8 
 601.3 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1060.3   255.66
 963.2 
 577 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress